More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4912 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  40.91 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  37.19 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  35.2 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  29.72 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  37.7 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  37.1 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  40.21 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  36.79 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  29.15 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.37 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 120 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  34.74 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  34.74 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  34.74 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  34.82 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 147 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  36.84 
 
 		 170 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 147 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  33 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  32.08 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  27.62 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 114 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  33.65 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 110 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>