More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0141 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  69.33 
 
 		 169 aa  224  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  65.06 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  58.58 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  59.76 
 
 		 173 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  59.75 
 
 		 173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  50.93 
 
 		 174 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 148 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 141 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  46.73 
 
 		 137 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 147 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  42.45 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  45.63 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  44.23 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.86 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  36.59 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  39.02 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  37.07 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  37.07 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 106 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  39 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  34.26 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  41.05 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  33.65 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.74 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  37.76 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  30.3 
 
 		 106 aa  67  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  33.68 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  33.68 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 113 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>