More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4033 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
215 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
215 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  99.53 
 
 
215 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  59.42 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  39.81 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
228 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 
239 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
218 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  37.56 
 
 
218 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  45.8 
 
 
237 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  34.58 
 
 
219 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 
222 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
230 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  43.55 
 
 
246 aa  95.5  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  32.84 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
233 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  32.34 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.53 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 
107 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  38 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.67 
 
 
268 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 
250 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  41.67 
 
 
154 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 
106 aa  70.5  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  43.14 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  39.8 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  39.62 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  39.8 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  37.1 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
112 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
112 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 
149 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  35.2 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  37.86 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  38.54 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  30.85 
 
 
111 aa  64.7  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
126 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 
113 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 
148 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  37.36 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
116 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 
130 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>