More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3375 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  45.21 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 236 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  36.44 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  35.14 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  36.91 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  43.44 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  42.73 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  33.66 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  37.32 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  40.5 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 130 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 120 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  32.39 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 113 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 114 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 113 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  35.51 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  42.71 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  37.37 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  37.37 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  37.37 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  37.37 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  37.37 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 116 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  31.63 
 
 		 106 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  40.23 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  30.39 
 
 		 111 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 108 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 106 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 101 aa  63.9  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 118 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  34.07 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>