More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0527 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  239  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  63.37 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  61.22 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  36.89 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1542  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  32.04 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  28.85 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3364  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  34.55 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  32.71 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  39.13 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  29.17 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  28 
 
 		 130 aa  57  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  35.24 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  28.57 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 225 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  30.21 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  34.02 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  28.12 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  28.12 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  32.73 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  32.18 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>