More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3781 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  77.16 
 
 		 162 aa  263  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 158 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 158 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 158 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  42.22 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  44.88 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  39.84 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  41.98 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  38.81 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  52.63 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  36.09 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  38.17 
 
 		 183 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 183 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 183 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  48.11 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  36.59 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 165 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  45.83 
 
 		 177 aa  90.9  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  35.77 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  38.46 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  36.44 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  42.71 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  35.46 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  43.16 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.44 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  42.27 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  36.52 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  34.59 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  33.85 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  31.11 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  35.25 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  31.71 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.57 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  34.35 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 209 aa  77.4  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  35.77 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  31.4 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 268 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  33.88 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  38.32 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>