More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3692 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  42.62 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  42.62 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  44.14 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  41.73 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  37.12 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  40.3 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  41 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 165 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  36.51 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  43 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  44.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  44.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  44.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  37.3 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  43.3 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  41 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.29 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  37.72 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.1 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  35.66 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.62 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  42.27 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42.71 
 
 		 268 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 244 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  33.59 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  33.9 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.43 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  36.3 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  33.9 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  35.56 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  35.24 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>