More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4116 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  335  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  64.19 
 
 		 157 aa  204  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  53.33 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  52.08 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  52.03 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  52.03 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  52.03 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  52.03 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  52.03 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  52.03 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  52.03 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  51.66 
 
 		 193 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  50.33 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  48.23 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  48.23 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  48.68 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  47.44 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  46.05 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  46.67 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  43.87 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  50.7 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  51.15 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 168 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  47.33 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  53.85 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  46.48 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.28 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  42.76 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  41.33 
 
 		 177 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  54.46 
 
 		 280 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  42.76 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  44.37 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  43.54 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  46.26 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 310 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  48.53 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 		 290 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  42.68 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  43.84 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  50 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 268 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 318 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  46.97 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  43.51 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  39.73 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  41.26 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  41.26 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  36.91 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  41.5 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.64 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 295 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 147 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  41.26 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  47.11 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  49.51 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 147 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 147 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>