More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2760 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
168 aa  349  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  81.07 
 
 
169 aa  286  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.67 
 
 
157 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
150 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  39.01 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  39.72 
 
 
157 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  36.57 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  33.79 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  32.87 
 
 
188 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  39.86 
 
 
177 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
162 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  45.97 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
162 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
160 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  41.09 
 
 
160 aa  94  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.41 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  36.88 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  38.03 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.72 
 
 
172 aa  90.9  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  35.66 
 
 
158 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  37.5 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  35 
 
 
177 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  37.5 
 
 
193 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  43.3 
 
 
121 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  38.41 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 
147 aa  87.8  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 
160 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
175 aa  87.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  36.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
193 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  36.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  34.72 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  36.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  34.03 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  34.03 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  34.03 
 
 
146 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  44.44 
 
 
165 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
135 aa  84.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  35.25 
 
 
157 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 
149 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 
168 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  33.8 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  36.09 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  43.62 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  33.82 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  32.58 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.51 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.51 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>