More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0996 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  54.74 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  50.76 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  47.92 
 
 		 187 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  52.17 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  57.26 
 
 		 177 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  56.45 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  54.4 
 
 		 193 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 171 aa  136  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  40.97 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  50.36 
 
 		 209 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  44.03 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 290 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  43.07 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  39.26 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  39.26 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  39.26 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  36.03 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  37.78 
 
 		 212 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  42.02 
 
 		 280 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  35.56 
 
 		 188 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.2 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  39.05 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  39.05 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  41.43 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40.62 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  37.86 
 
 		 268 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  43.3 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  37.86 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 244 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 179 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  37.98 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  38.21 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  37.98 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  37.98 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  37.98 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.1 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  36.62 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>