More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2675 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  350  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  65.58 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  39.16 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 244 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  41.35 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  38.46 
 
 		 268 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  37.58 
 
 		 163 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  37.58 
 
 		 163 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  44.95 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  37.16 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 147 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 153 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  40.77 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 162 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 162 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 135 aa  97.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  37.67 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  35 
 
 		 212 aa  94.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  41.13 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  34.62 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  36.67 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 148 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  43 
 
 		 170 aa  90.9  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  38.02 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  36.29 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.43 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  40.37 
 
 		 183 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 280 aa  87.8  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  38.6 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 152 aa  87.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  36.7 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  34.86 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 310 aa  84.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 149 aa  84.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  33.8 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  38.78 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  36.64 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  36.51 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  35.38 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>