More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5189 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 165 aa  341  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  51.63 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  40.88 
 
 		 212 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  40.58 
 
 		 188 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  36.2 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  44.53 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  40.94 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  37.42 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  37.88 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.06 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  42.75 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  51.96 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  45.9 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 149 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  34.64 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40.3 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  35.15 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  40.3 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  43.75 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  36.5 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 290 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  34.93 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  47.31 
 
 		 187 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 310 aa  94  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 280 aa  93.6  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  31.87 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  31.87 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  31.54 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  34.51 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  34.75 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 158 aa  90.9  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  46.74 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 121 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  32.17 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  46.74 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  46.74 
 
 		 268 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 		 244 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  36.17 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 318 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 155 aa  88.2  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 169 aa  87.8  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  36.17 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 295 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 130 aa  85.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 106 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>