More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0274 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  100 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  64.19 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  52 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  48.97 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  51.06 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  49.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  49.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  49.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  49.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  49.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  49.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  49.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  49.32 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  47.3 
 
 		 209 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  45.89 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  46.98 
 
 		 193 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  45.95 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  45.21 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.62 
 
 		 188 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  45.32 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  44.53 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  51.64 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.67 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  44.3 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.33 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  47.33 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  47.5 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  46.31 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  46.77 
 
 		 280 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.94 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  41.55 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  44.22 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  38.41 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 		 290 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  43.41 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  50.46 
 
 		 268 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  50.46 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  50.46 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  50.46 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  50.46 
 
 		 244 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  50.46 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  50.46 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  42.34 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  43.51 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  46.22 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  40.69 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  44.85 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  42.18 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  42.34 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  41.22 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  43.28 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  49.51 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  41.83 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  41.83 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 310 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 318 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.64 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  43.8 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 179 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  43.8 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  40.15 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  45.54 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>