More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0502 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  340  7e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  42.68 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  42.77 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  44.53 
 
 		 212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  44.53 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  44.53 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  44.53 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  44.53 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  44.53 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  44.53 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  44.53 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  40.15 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  39.31 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  38.13 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  38.19 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 318 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  94.4  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  37.2 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  35.46 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  36.62 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  34.46 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  34.04 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  39.1 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  34.46 
 
 		 280 aa  88.2  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 149 aa  87.8  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 168 aa  87.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  34.48 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  37.24 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  37.24 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 244 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  37.3 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  36.43 
 
 		 148 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 		 121 aa  84  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.71 
 
 		 268 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  36.94 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  33.8 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  32.59 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  31.85 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  32.39 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  34.06 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  32.56 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  33.79 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>