More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0237 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  360  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  66.46 
 
 
172 aa  226  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  62.96 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  59.32 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  61.15 
 
 
161 aa  195  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  59.21 
 
 
209 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  49.38 
 
 
175 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  53.21 
 
 
168 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  55.41 
 
 
171 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 
168 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  49.07 
 
 
168 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  54.74 
 
 
150 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  56.06 
 
 
158 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  55.74 
 
 
149 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  54.35 
 
 
145 aa  148  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  51.03 
 
 
158 aa  147  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  54.81 
 
 
147 aa  147  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  56.35 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
147 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  44.74 
 
 
212 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  43.24 
 
 
188 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 
158 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  41.77 
 
 
158 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  45.16 
 
 
170 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  41.77 
 
 
158 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 
158 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 
158 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  41.77 
 
 
158 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 
158 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
163 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
162 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 
170 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
160 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
150 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 
159 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
162 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  48.3 
 
 
147 aa  117  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 
148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
152 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
160 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  43.28 
 
 
148 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  43.94 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  41.18 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  38.41 
 
 
157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40.44 
 
 
157 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  48.36 
 
 
159 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
168 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
167 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
179 aa  110  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  46.1 
 
 
135 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  36.81 
 
 
186 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  40.13 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  45.9 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  50.98 
 
 
131 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 
149 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  45.19 
 
 
148 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.4 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  42.14 
 
 
183 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  42.14 
 
 
183 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  42.65 
 
 
146 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  42.65 
 
 
146 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  42.22 
 
 
178 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  41.61 
 
 
165 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.4 
 
 
268 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  42.22 
 
 
244 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  48.91 
 
 
162 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  42.34 
 
 
150 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  42.14 
 
 
166 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
152 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
172 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
172 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
147 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
156 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
149 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
165 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  43.31 
 
 
183 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 
147 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
318 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
158 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
158 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
158 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 
165 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>