More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6089 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 166 aa  338  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  50 
 
 		 212 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  47.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  47.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  47.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  46.26 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  44.87 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  46.9 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  42.86 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  46.04 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  46.32 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  44.52 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  48.23 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  46.1 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  43.84 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 318 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  45.86 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  40.29 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  45 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  42.67 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  46.71 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  36.55 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  37.88 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  48.39 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  43.33 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  52.78 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 280 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  49.07 
 
 		 290 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 310 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  40.4 
 
 		 177 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 209 aa  97.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  37.59 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  41.73 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  39.35 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 193 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  46.02 
 
 		 121 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  44.03 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  36.88 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  36.88 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  35.1 
 
 		 186 aa  91.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  48.96 
 
 		 187 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  43.64 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  39.61 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  43.64 
 
 		 268 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 244 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  43.64 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  36.6 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.4 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  38.6 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 131 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  39.07 
 
 		 307 aa  87.8  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 151 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  43.27 
 
 		 146 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  44.76 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  42.31 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>