More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0093 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  46.31 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  45.07 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  47.97 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  45.77 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  43.92 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  43.92 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  43.92 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  43.92 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  40.13 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  37.66 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  40.85 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  39.19 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 318 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  35.86 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  42.64 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 290 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42 
 
 		 268 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  43.75 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  43.75 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 149 aa  97.1  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  34.11 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  39.22 
 
 		 177 aa  94.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 148 aa  94  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 148 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.16 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  36.92 
 
 		 280 aa  91.3  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  38.18 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  41.75 
 
 		 146 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  34.06 
 
 		 193 aa  90.9  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 307 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  31.61 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  31.01 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  40.78 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 183 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 183 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 147 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>