More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0945 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  56.08 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  57.93 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 150 aa  137  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  45.07 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  45.07 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  51.64 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  41.26 
 
 		 188 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  45.07 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  45.89 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  40.54 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  41.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  41.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  41.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  41.38 
 
 		 212 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 310 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  39.85 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.55 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  39.07 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  42.52 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 318 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  51.4 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  44.68 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  40.31 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.72 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  42.02 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  39.16 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  42.02 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  42.02 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  42.02 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42.02 
 
 		 268 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 244 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  38.76 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  44.26 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  37.12 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  38.76 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  43.65 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  41.09 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  38.84 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  40.97 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.6 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 		 280 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.51 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  38.13 
 
 		 209 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 290 aa  90.9  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  39.58 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 135 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  41.6 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  41.1 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>