More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2581 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 178 aa  304  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  304  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  98.69 
 
 		 154 aa  299  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  98.04 
 
 		 268 aa  295  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  58.9 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  58.22 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 151 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  59.03 
 
 		 163 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  59.03 
 
 		 163 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  58.67 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  58.9 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  55.78 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  55.48 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  55.48 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  54.17 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  53.69 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  50.7 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  51.7 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  54.68 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  54.74 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  47.26 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40.85 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  45.59 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  40.14 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  42.18 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  41.78 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  50.46 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  43.94 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  42.57 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  46.28 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  40.4 
 
 		 177 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  45.8 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.29 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 209 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  40.15 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 290 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  52.17 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  42.02 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  33.8 
 
 		 165 aa  98.6  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  48.7 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  42.27 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 280 aa  94.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  36.5 
 
 		 212 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  36.5 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  36.5 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  47.87 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  36.5 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  42.37 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>