More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0545 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  67.36 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  67.36 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  67.36 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  67.36 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 149 aa  197  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  65.77 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  65.77 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  60.4 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 147 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  62.25 
 
 		 152 aa  185  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  58.5 
 
 		 150 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  59.44 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  57.82 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 147 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  59.72 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  59.59 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 147 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  60.27 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  55.7 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 244 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 154 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 154 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  55.7 
 
 		 154 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 154 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 152 aa  171  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  55.03 
 
 		 268 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 156 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 156 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 156 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  52.74 
 
 		 148 aa  160  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  51.37 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  51.82 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  51.13 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  48.25 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  46.72 
 
 		 150 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  45.39 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  46.1 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  41.48 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  42.34 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.18 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  44.44 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  45.32 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  39.57 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.13 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  38.13 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  37.14 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 280 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  35.21 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 		 147 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  40.46 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 		 290 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  35.21 
 
 		 157 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 150 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 148 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  36.43 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  36.43 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  48.31 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 149 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 163 aa  84.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  32.62 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>