More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3663 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  59.83 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  53.98 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  49.56 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 230 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  35.35 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  36.46 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  34.34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  34.34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  34.34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  38.95 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  33.01 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.34 
 
 		 212 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  38.54 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  35.58 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.94 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  41.94 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  37.89 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0720  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0201705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>