More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1635 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  72.27 
 
 		 119 aa  184  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  69.75 
 
 		 119 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  68.07 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  41.24 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  40.21 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  40.21 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  40.21 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  40.21 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  34 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  40.21 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  38.2 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  32.71 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  31.43 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  30.1 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  36.08 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  32.17 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  33.67 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  34.02 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  39.39 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  39.39 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1133  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  34.88 
 
 		 225 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  32.41 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  29.9 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  32.74 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  30 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  28.87 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  33.33 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  29.36 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  32.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  28.57 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3142  helix-turn-helix, HxlR type  35.79 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933421  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  32.99 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  32.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>