More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06336 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  69.83 
 
 		 119 aa  184  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  64.66 
 
 		 118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  63.79 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  38.21 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  37.11 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  40.4 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  40.4 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.39 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  40.4 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  40.4 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  40.4 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  39.18 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  39.18 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  39.18 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  39.18 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  39.18 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  40.82 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  39.18 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  38.3 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  38 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  35.35 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  36.61 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  35.42 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>