More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4220 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
116 aa  237  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
106 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  48.91 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  48.91 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  48.91 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  48.91 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  48.91 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 
106 aa  94  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 
108 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 
107 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 
111 aa  93.6  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  45.19 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  47.87 
 
 
114 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  47.87 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40 
 
 
122 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  45.74 
 
 
113 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  43.96 
 
 
124 aa  87  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 
124 aa  87  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.62 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  41.84 
 
 
103 aa  85.9  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  42.42 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  38.78 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  44.68 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 
229 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
118 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 
137 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  43 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  42 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  42 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  41.9 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  41.9 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  41.9 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  40 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  38.38 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  40.4 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40.95 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  43 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.9 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  38.94 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  38.6 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  40.38 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.94 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  40.19 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  38.68 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.4 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>