More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2471 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  261  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 116 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  46.32 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  39.67 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  42.61 
 
 		 113 aa  93.6  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.59 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  39.62 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  45.74 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 119 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  42 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  42 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  43.62 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  41.51 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  42 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  34.71 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  38.74 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  40.82 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  38.74 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  38.74 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  39.25 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  47 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  38.74 
 
 		 220 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  38.74 
 
 		 206 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  47.25 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  47.25 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.25 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.25 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.25 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  47.25 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  40.59 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  43.33 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  43.43 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 116 aa  83.6  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>