More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1070 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  52.13 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  42.57 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  42.45 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  36 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.26 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  44.21 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  44.21 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  44.21 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  44.21 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  44.21 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  38.33 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  41.35 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  39.45 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  39.39 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  41.24 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  39.39 
 
 		 220 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  34.92 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  34.92 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  34.92 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  47.78 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  44.32 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  42.86 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  44.32 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  41.49 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  36.17 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  32.46 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.74 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>