More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1091 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  253  7e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  86.27 
 
 		 113 aa  195  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  64.71 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  41.49 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 223 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 223 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 223 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  37.11 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  38.04 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.96 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.96 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.96 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.96 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  30.93 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  33.98 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  37.5 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  30.85 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  30.85 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  30.61 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  31.52 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  32.63 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  31.91 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  36.21 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  31.52 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>