More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2636 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  70.73 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  59.13 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  40.57 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  46.32 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  46.32 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.21 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  45.26 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  36.73 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  38.6 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  41.05 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  43.48 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 272 aa  74.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  38.94 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  40.2 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  42.71 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  40.57 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  42.27 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  42.39 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  36.36 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  41.57 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  41.24 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  44.87 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  42.39 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  42.27 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  42.27 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  42.27 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  42.27 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  39.62 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2848  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>