More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2848 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2848  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 109 aa  222  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  79.82 
 
 		 115 aa  177  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  39.18 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  39.13 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  39.24 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  38.27 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  51.67 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  34.44 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  35.8 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  35.23 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  32.93 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  35.8 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  39.02 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  32.1 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  32.1 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  32.1 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  32.56 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  32.1 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  34.91 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  34.31 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  38.82 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  34.52 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  37.18 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  30.36 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.66 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2189  HxlR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.27 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  31.33 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  31.33 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1511  HxlR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.353103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  31.71 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  29.11 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  32.95 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  28.42 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  30.49 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  25.56 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  33.71 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1133  transcriptional regulator, HxlR family  34.09 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  25.56 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  28.42 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2599  HxlR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  30.86 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>