More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0977 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  70.73 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  50.89 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  39.5 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  43.43 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  49.35 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  35.45 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  45.68 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  44.32 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  44.32 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  44.32 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  44.32 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  44.32 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  39.76 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  39.33 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.64 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  43.53 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  40.96 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  40.21 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  42.55 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  40.21 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  45.57 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  41.57 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  42.55 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  43.53 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  43.16 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2848  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  46.91 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  45.24 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  40.45 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  38.82 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 170 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  35.4 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  42.05 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  32.35 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  38.27 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  32.58 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  38.27 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>