More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0241 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  45.6 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  40.68 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  38.68 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  35.77 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4573  HxlR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0183  HxlR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  44.87 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4835  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  36.11 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  33.91 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6809  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  39.36 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  36.08 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  36.36 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  43.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  43.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  43.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  43.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  43.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  43.02 
 
 		 272 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  31.01 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0298  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1511  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.353103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  39.33 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>