More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0298 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0298  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4654  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  44.21 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.18 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.18 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.18 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.18 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.18 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.22 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.22 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.18 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  39.51 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  40.22 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  41.38 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  43.68 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  32.11 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  37.11 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  37.11 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  45.56 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  37.11 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  38.14 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  42.7 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  34.34 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>