More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2483 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  234  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3019  transcriptional regulator, HxlR family  38.32 
 
 		 247 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.179056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 115 aa  84.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  35.45 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  36.96 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  40.22 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  36.96 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>