More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3019 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3019  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.179056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0701  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  53.91 
 
 
142 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1140  transcriptional regulator, HxlR family  53.61 
 
 
102 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0964715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2560  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.69 
 
 
144 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1554  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.87 
 
 
157 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.70083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  36.28 
 
 
121 aa  88.6  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
116 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
160 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
120 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 
155 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 
128 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 
119 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 
119 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
112 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
159 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
124 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  38.68 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  38.68 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  38.68 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  38.68 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  38.68 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  38.32 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  38.68 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  38.32 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  38.68 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1432  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.56 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  27.53 
 
 
280 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  38.3 
 
 
125 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  37.76 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
124 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
121 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
125 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  40.43 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.62 
 
 
114 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  40.43 
 
 
126 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  38 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 
113 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.62 
 
 
114 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  40.43 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.62 
 
 
114 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.62 
 
 
114 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.62 
 
 
114 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  40.43 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
118 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.62 
 
 
114 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  40.43 
 
 
126 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  40.43 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  40.43 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  40.86 
 
 
129 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  42.11 
 
 
110 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 
106 aa  77  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  37.14 
 
 
114 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  36 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  38.32 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  38.32 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 
137 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 
151 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 
113 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
114 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  33.64 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  38.68 
 
 
122 aa  72  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
133 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  37.14 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  37.14 
 
 
114 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  37.14 
 
 
114 aa  72  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  37.14 
 
 
114 aa  72  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 
177 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 
116 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0298  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 
112 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
122 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  36.17 
 
 
130 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>