More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5072 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
117 aa  241  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  57.01 
 
 
119 aa  130  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  60.19 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  59.18 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  54.81 
 
 
116 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  54.9 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  56.12 
 
 
118 aa  120  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
112 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
112 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
112 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  51 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  51 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  51 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  51 
 
 
124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  51 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  51 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  51 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  51 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  52.21 
 
 
119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  51 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  53.92 
 
 
121 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 
115 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  53.33 
 
 
116 aa  113  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 
119 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  47.32 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  49.5 
 
 
110 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
114 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  46.53 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  47.52 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  47.52 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  46.53 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  46.53 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  47.87 
 
 
107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.37 
 
 
107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
115 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
129 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  48.51 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  45.54 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  47.87 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 
118 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  52.04 
 
 
116 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 
108 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  45.71 
 
 
115 aa  107  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  47.47 
 
 
114 aa  105  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  46.79 
 
 
155 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.79 
 
 
132 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 
119 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
133 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 
107 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 
109 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 
134 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
116 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  46.32 
 
 
107 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 
106 aa  104  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
107 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  43.24 
 
 
130 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 
117 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  49.49 
 
 
112 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 
127 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 
134 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  49.49 
 
 
112 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  46.32 
 
 
107 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  46.32 
 
 
107 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
107 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  50 
 
 
235 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  41.75 
 
 
140 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 
149 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 
151 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
115 aa  100  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  44.66 
 
 
130 aa  100  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 
119 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  50.52 
 
 
122 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
148 aa  100  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 
121 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 
125 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
117 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
122 aa  99.4  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  43.56 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>