More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1803 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  46.33 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 236 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  34.07 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  34.98 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 106 aa  86.3  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  46.24 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 113 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  36.41 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 121 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  30.84 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  39.5 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 130 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  30 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  42.55 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 124 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 106 aa  71.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  30.84 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  43.3 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1347  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  35.35 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  35.9 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  34.55 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 112 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.56 
 
 		 112 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 114 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  32.41 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  33.05 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  31.36 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  32.67 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>