More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2549 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  58.33 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  48.82 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 223 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  49.61 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  32.89 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  33.15 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  40.19 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.14 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  33.15 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  35.83 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  38.32 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 118 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  32.39 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  38.83 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  38.83 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 120 aa  72  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 172 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 156 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 140 aa  72  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 172 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 156 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  33.01 
 
 		 106 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  36.28 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 120 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 108 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 121 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  36.94 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 116 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>