More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4087 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 173 aa  344  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  59.75 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  58.75 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  51.18 
 
 		 191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 176 aa  174  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  44.91 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 141 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 147 aa  98.6  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  44.34 
 
 		 140 aa  91.3  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  36.91 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  41.74 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.74 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  41.74 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  44.04 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  44.04 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  33.53 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  37.86 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  39.36 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  33.78 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  37.62 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  33.79 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  36.67 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  41.35 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  31 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  33.61 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>