More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2199 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  42.11 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  55.34 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  32.39 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  29.81 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  43.82 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  36.23 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  34.31 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  40.66 
 
 		 171 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 150 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  25.99 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  38.46 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  38.46 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40.82 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  39.8 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  37 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  37 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  45.76 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 112 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  36.14 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  33.65 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 148 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  32.74 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 112 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  39 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  39 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  39 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>