More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1805 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  36.74 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  31.36 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  30.32 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  33.93 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  33.9 
 
 		 135 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  33.93 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  31.78 
 
 		 150 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 111 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  40.21 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  40.21 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  40.21 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  40.21 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  40.21 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  40.21 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  40.21 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 104 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  25.82 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 119 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 113 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  33.02 
 
 		 120 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 113 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  31 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 104 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3781  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  32.32 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  32.35 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  31.43 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  28.78 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  29.13 
 
 		 130 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  31 
 
 		 127 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1347  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 132 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  63.9  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  29.73 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  30.21 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  34.69 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>