More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2191 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  61.17 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  55.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  47.57 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  47.57 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  47.57 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  47.57 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  47.57 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  47.57 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  47.57 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  47.57 
 
 		 107 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  47.57 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  49.5 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  48.51 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  39.33 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  34.26 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  32.32 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 216 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0916  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000825483  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  31.62 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  37.11 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  31.63 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  40.86 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  35.11 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  37.21 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  36.26 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  31 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>