More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1393 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  246  7e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  57 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  46.39 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  49.48 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  49.48 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  49.48 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  49.48 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  49.48 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  49.48 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  49.48 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  49.48 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0916  transcriptional regulator  46.59 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000825483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  44.32 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  39.08 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  37 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  36.78 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  38.2 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  35.96 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  33.71 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  37.65 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  31.3 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  35.58 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  32 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  39.29 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  33.71 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  34.83 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>