More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2378 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  65.69 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  41.76 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40.62 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 187 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  34.69 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3364  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1542  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  39.39 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  33.7 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  33.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  33.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  34.69 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  30 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  29.9 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  38.14 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>