More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0014 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
112 aa  100  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  54.22 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50.54 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  42.31 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 
113 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  50.56 
 
 
148 aa  92  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
159 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  47.83 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  49.49 
 
 
114 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  49.49 
 
 
114 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  45.65 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.68 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  43.43 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  46.74 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
114 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  46.74 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 
130 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  46.94 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  48.48 
 
 
114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  48.48 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  43 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  45.65 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  51.65 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  49.45 
 
 
114 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  49.45 
 
 
114 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  49.45 
 
 
114 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  49.45 
 
 
114 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  49.45 
 
 
114 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  49.45 
 
 
114 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 
129 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  50.55 
 
 
115 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  50.55 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  50.55 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.62 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  50.55 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  50.55 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  49.45 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  49.45 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  43.43 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  48.35 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0611  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
127 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 
121 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
125 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  48.35 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  39.32 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  45.65 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  45.65 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  47.25 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  45.65 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  45.65 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  45.65 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  47.25 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  47.25 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.65 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  45.65 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  41.05 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>