More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2058 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 136 aa  276  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  55.38 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  54.08 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  52.04 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  56.44 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  45.3 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  39.34 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  38.68 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  39.58 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  39.36 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.86 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  40.86 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  37.86 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 239 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  37 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  35.71 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0720  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0201705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  39.42 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  39.42 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 290 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 209 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.89 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  36.84 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  38.83 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  37 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>