More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2078 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 141 aa  286  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  50.94 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  48.21 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  47.2 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 117 aa  105  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  41.51 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  43.24 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  38.32 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.53 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.53 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  38.53 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  37.17 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  37.17 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  37.17 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  37.17 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  37.17 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  37.61 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  37.17 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  38.05 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  38.05 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  38.89 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  41.49 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  41.94 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  38.46 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  36.97 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  30.83 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.23 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  36.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  36.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40.23 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  34.48 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  34.48 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  39.08 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  36.19 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  34.48 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>