More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4258 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  65.81 
 
 		 117 aa  168  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  58.65 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  52.48 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 118 aa  105  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  42.72 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  43.56 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  42.71 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.08 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  36.04 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  37.36 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  34.31 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  35 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  34 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  34 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  34 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  36.78 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  36.78 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  37.36 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  33.67 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  37.36 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  32 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>