More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3103 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  230  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  63.81 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  65.09 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  54.81 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  41.51 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  41.28 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  32.11 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 129 aa  95.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  39.09 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  34.55 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  39.62 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  32.38 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 115 aa  87.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  33.98 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  34.86 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  41.49 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  39.78 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  41.49 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.49 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  41.49 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.49 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.49 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  39.78 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  41.49 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  41.57 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  41.24 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  41.94 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  41.24 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  38.18 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  38.71 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40.21 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  36.61 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  36.61 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  36.61 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  36.61 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  36.61 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  36.61 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  40.66 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  39.36 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  39.36 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  45.98 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  39.36 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>