More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2125 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  46.38 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  37.06 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  35.37 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.48 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  34.48 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  34.48 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  34.48 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.41 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  33.54 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  38.69 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 140 aa  94.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  35.81 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  36.88 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  35.77 
 
 		 209 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  32.17 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  35.25 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 147 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  36.5 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  34.97 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  31.88 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  35.2 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  43.62 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  31.51 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 168 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  36.72 
 
 		 149 aa  84  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  32.61 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  34.17 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  30.99 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  32.24 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  41.24 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  41.24 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  31.2 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  28.87 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 244 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  28.87 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  31.71 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 290 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  27.89 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  31 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 280 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>