More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2159 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2159  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
111 aa  231  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2197  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  231  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  31.43 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0916  transcriptional regulator  32.67 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000825483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  33 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  33 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  33 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  33 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  33 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  33 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  30.69 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  33 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  33 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  33 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
122 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0349  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 
173 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.002676  normal  0.361598 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  33.65 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  31 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  32.32 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  31.31 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  31.48 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1347  transcriptional regulator  35.29 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  31.63 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  26 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  35.42 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  33.67 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  27.88 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  28.97 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  29.17 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  29 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  27.08 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  27.84 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  30.85 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  32.35 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  30.3 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  29.59 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  27.37 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  31 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  25.74 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  29.59 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  29.29 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  29 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  28.12 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3142  helix-turn-helix, HxlR type  35.42 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933421  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  29.52 
 
 
125 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  24.49 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  27.96 
 
 
133 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  29.17 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  26.32 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  29.29 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 
127 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
118 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  31.31 
 
 
113 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  29.29 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
125 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  29.29 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  32.98 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  30.53 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  28.16 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  30.53 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  30.53 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  30.53 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>